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癌症治療中的次世代定序分析是什麼?

精準醫學及次世代定序專題

(一)甚麼是「精準醫學」及「次世代定序分析」(NGS)?

精準醫學又稱為個人化醫學建議,其理念除了與病人進行一些例如抽血、X光、超聲波等等常規的檢測外,還會另外加上生物醫學檢測元素,例如腫瘤或病人本身的基因檢測。然後將這些個人資料與人體基因資料庫作對比,再於大數據之中去分析,從而幫助找到最適合患者的治療方法或藥物。即使是同一個疾病,在不同人身上得到的治療方式或藥物也不一樣,其主要目的是找出最高治療效果,同時減少不必要的副作用的個人化治療方法。

次世代排序,即Next Generation Sequencing,主要是一個同時間作大流量的基因排序方法,在短時間內將有興趣的基因排序出來。如果將其與傳統的Sanger Sequencing Sanger 排序比較,次世代排序的速度快超過六萬倍以上。

大家可能還聽過一個叫做人類基因體計劃的項目,其于九十年代開始,前後用了15年時間,花費三十億美元。但如果使用次世代排序方法去做,其速度能夠快六萬倍,我們可以將這個計劃由以前的十五年縮短到一至兩日內完成,而花費的成本亦只是幾萬分之一。由於速度實在相差太大,這類新一代基因排序方法都稱為次世代排序。

(二)次世代定序分析(NGS)在癌症治療中擔當甚麼角色? 

次世代排序分析在癌症治療當中最主要擔任的角色是作一個全面的腫瘤基因檢測,找出所有有可能與腫瘤病變相關的基因。其中有部分基因突變,是令腫瘤不受控制地生長最主要的原因,稱之為主驅動基因。一旦發現這類主驅動基因,我們可以相應地用一些針對性藥物作腫瘤治療。在治療肺癌上最主要應用次世代排序分析的情況是在擴散性非小細胞性肺癌上,尤其是當中最常見的一種稱為肺腺癌的肺癌。因為我們知道超過八成半以上的肺腺癌患者都有我先前提及過的主驅動基因,而其中超過六成以上有適合的標靶藥可以使用。這些標靶藥大部份都以口服形式服用,功效比傳統化療藥的藥效為高,同時副作用更少。

國際上有四種基因突變,分別是EGFR,ALK,ROS-1以及BRAF,一般都會建議用標靶藥物作為一線治療。另外有超過五種以上主驅動基因有相關藥物可以使用,為晚期肺癌病人帶來一線生機。

(三)為甚麼次世代定序分析 (NGS) 仍未被廣泛使用?

次世代排序分析仍未廣泛使用的其中一個原因是價錢問題。其價錢一般為兩萬至四萬元不等,視乎你所檢測的基因涵蓋幅度以及檢測方法。另外有很多在外國已經普遍使用的標靶藥,在香港公立醫院都未能成功註冊,在某程度上也限制了公立醫院醫生作出適當的檢測建議。但隨科技的進步,次世代排序分析的價格會慢慢降低,相關標靶藥最終會納入公立醫院的藥物名冊,將來一定會被廣泛使用於每一位肺癌病人身上。

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